Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms