Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA6Q15825 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms