Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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PTPRRQ15256 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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