Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GAPVD1Q14C86 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
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