Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IHHQ14623 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IHHQ14623 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IHHQ14623 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IHHQ14623 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IHHQ14623 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IHHQ14623 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IHHQ14623 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IHHQ14623 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IHHQ14623 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IHHQ14623 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IHHQ14623 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IHHQ14623 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IHHQ14623 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IHHQ14623 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IHHQ14623 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IHHQ14623 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IHHQ14623 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IHHQ14623 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IHHQ14623 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IHHQ14623 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IHHQ14623 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IHHQ14623 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IHHQ14623 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IHHQ14623 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IHHQ14623 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IHHQ14623 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IHHQ14623 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IHHQ14623 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IHHQ14623 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IHHQ14623 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IHHQ14623 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IHHQ14623 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms