Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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GBX1Q14549 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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GBX1Q14549 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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GBX1Q14549 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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GBX1Q14549 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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GBX1Q14549 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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GBX1Q14549 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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GBX1Q14549 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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GBX1Q14549 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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GBX1Q14549 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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GBX1Q14549 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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