Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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CBFBQ13951 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
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CBFBQ13951 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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CBFBQ13951 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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CBFBQ13951 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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CBFBQ13951 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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CBFBQ13951 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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CBFBQ13951 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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