Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
APOFQ13790 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
APOFQ13790 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.11
APOFQ13790 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
APOFQ13790 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
APOFQ13790 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
APOFQ13790 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
APOFQ13790 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
APOFQ13790 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
APOFQ13790 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
APOFQ13790 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
APOFQ13790 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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APOFQ13790 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
APOFQ13790 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
APOFQ13790 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
APOFQ13790 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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APOFQ13790 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
APOFQ13790 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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APOFQ13790 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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APOFQ13790 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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APOFQ13790 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOFQ13790 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOFQ13790 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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APOFQ13790 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOFQ13790 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOFQ13790 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOFQ13790 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
APOFQ13790 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOFQ13790 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOFQ13790 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
APOFQ13790 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOFQ13790 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOFQ13790 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOFQ13790 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOFQ13790 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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