Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms