Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms