Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NAE1Q13564 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NAE1Q13564 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NAE1Q13564 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NAE1Q13564 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.05■□□□□ 0
NAE1Q13564 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NAE1Q13564 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NAE1Q13564 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NAE1Q13564 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NAE1Q13564 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NAE1Q13564 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NAE1Q13564 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NAE1Q13564 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NAE1Q13564 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NAE1Q13564 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NAE1Q13564 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NAE1Q13564 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NAE1Q13564 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NAE1Q13564 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NAE1Q13564 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NAE1Q13564 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NAE1Q13564 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NAE1Q13564 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NAE1Q13564 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NAE1Q13564 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NAE1Q13564 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NAE1Q13564 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NAE1Q13564 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NAE1Q13564 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NAE1Q13564 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NAE1Q13564 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NAE1Q13564 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NAE1Q13564 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NAE1Q13564 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NAE1Q13564 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NAE1Q13564 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NAE1Q13564 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NAE1Q13564 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NAE1Q13564 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NAE1Q13564 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NAE1Q13564 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NAE1Q13564 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NAE1Q13564 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NAE1Q13564 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NAE1Q13564 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NAE1Q13564 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NAE1Q13564 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NAE1Q13564 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NAE1Q13564 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NAE1Q13564 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NAE1Q13564 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NAE1Q13564 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NAE1Q13564 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms