Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BFSP2Q13515 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BFSP2Q13515 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms