Protein–RNA interactions for Protein: Q13371

PDCL, Phosducin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCLQ13371 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDCLQ13371 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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