Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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ITGB3BPQ13352 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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ITGB3BPQ13352 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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ITGB3BPQ13352 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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ITGB3BPQ13352 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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ITGB3BPQ13352 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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ITGB3BPQ13352 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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ITGB3BPQ13352 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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ITGB3BPQ13352 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ITGB3BPQ13352 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
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