Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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