Protein–RNA interactions for Protein: Q05932

FPGS, Folylpolyglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGSQ05932 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FPGSQ05932 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms