Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms