Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RELAQ04206 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RELAQ04206 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RELAQ04206 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RELAQ04206 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RELAQ04206 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RELAQ04206 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RELAQ04206 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RELAQ04206 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RELAQ04206 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RELAQ04206 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RELAQ04206 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RELAQ04206 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RELAQ04206 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RELAQ04206 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RELAQ04206 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RELAQ04206 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RELAQ04206 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RELAQ04206 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RELAQ04206 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RELAQ04206 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RELAQ04206 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RELAQ04206 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RELAQ04206 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RELAQ04206 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RELAQ04206 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RELAQ04206 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RELAQ04206 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RELAQ04206 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RELAQ04206 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RELAQ04206 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RELAQ04206 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RELAQ04206 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RELAQ04206 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RELAQ04206 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RELAQ04206 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RELAQ04206 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RELAQ04206 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RELAQ04206 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RELAQ04206 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RELAQ04206 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RELAQ04206 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RELAQ04206 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RELAQ04206 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RELAQ04206 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RELAQ04206 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RELAQ04206 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RELAQ04206 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RELAQ04206 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RELAQ04206 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RELAQ04206 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RELAQ04206 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms