Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms