Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP27A1Q02318 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP27A1Q02318 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms