Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COG7P83436 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COG7P83436 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COG7P83436 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COG7P83436 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COG7P83436 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COG7P83436 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG7P83436 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
COG7P83436 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG7P83436 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG7P83436 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG7P83436 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG7P83436 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG7P83436 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG7P83436 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG7P83436 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG7P83436 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG7P83436 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG7P83436 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG7P83436 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG7P83436 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG7P83436 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG7P83436 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG7P83436 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG7P83436 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG7P83436 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG7P83436 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG7P83436 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG7P83436 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG7P83436 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG7P83436 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG7P83436 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG7P83436 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG7P83436 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG7P83436 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG7P83436 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG7P83436 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
COG7P83436 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG7P83436 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG7P83436 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
COG7P83436 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG7P83436 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG7P83436 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG7P83436 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG7P83436 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG7P83436 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG7P83436 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG7P83436 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COG7P83436 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COG7P83436 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COG7P83436 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COG7P83436 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COG7P83436 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COG7P83436 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COG7P83436 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COG7P83436 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
COG7P83436 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms