Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms