Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HBBP68871 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms