Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms