Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
UFM1P61960 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UFM1P61960 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UFM1P61960 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UFM1P61960 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UFM1P61960 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UFM1P61960 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UFM1P61960 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UFM1P61960 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UFM1P61960 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UFM1P61960 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UFM1P61960 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UFM1P61960 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UFM1P61960 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UFM1P61960 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
UFM1P61960 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UFM1P61960 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UFM1P61960 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UFM1P61960 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UFM1P61960 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
UFM1P61960 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
UFM1P61960 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
UFM1P61960 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
UFM1P61960 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UFM1P61960 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UFM1P61960 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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