Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 EXOC5-202ENST00000413566 8513 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 PTPRG-201ENST00000295874 4650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 AC099489.1-203ENST00000598234 10568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HERVK_113P61574 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms