Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSCP56915 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSCP56915 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSCP56915 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSCP56915 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSCP56915 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSCP56915 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSCP56915 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GSCP56915 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSCP56915 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSCP56915 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GSCP56915 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSCP56915 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSCP56915 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSCP56915 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GSCP56915 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSCP56915 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSCP56915 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSCP56915 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSCP56915 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSCP56915 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSCP56915 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSCP56915 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSCP56915 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSCP56915 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSCP56915 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSCP56915 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GSCP56915 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSCP56915 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSCP56915 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSCP56915 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSCP56915 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSCP56915 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSCP56915 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSCP56915 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSCP56915 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSCP56915 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSCP56915 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSCP56915 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSCP56915 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSCP56915 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSCP56915 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSCP56915 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSCP56915 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSCP56915 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSCP56915 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSCP56915 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSCP56915 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSCP56915 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSCP56915 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSCP56915 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSCP56915 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSCP56915 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSCP56915 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSCP56915 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSCP56915 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSCP56915 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GSCP56915 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSCP56915 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSCP56915 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSCP56915 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GSCP56915 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSCP56915 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSCP56915 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSCP56915 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSCP56915 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSCP56915 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSCP56915 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSCP56915 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSCP56915 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSCP56915 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSCP56915 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSCP56915 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSCP56915 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GSCP56915 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GSCP56915 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GSCP56915 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GSCP56915 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GSCP56915 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GSCP56915 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GSCP56915 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GSCP56915 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GSCP56915 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GSCP56915 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSCP56915 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSCP56915 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSCP56915 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSCP56915 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSCP56915 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSCP56915 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSCP56915 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GSCP56915 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSCP56915 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GSCP56915 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSCP56915 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GSCP56915 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSCP56915 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSCP56915 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSCP56915 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSCP56915 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms