Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AIF1P55008 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AIF1P55008 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AIF1P55008 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AIF1P55008 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AIF1P55008 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AIF1P55008 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AIF1P55008 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AIF1P55008 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AIF1P55008 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AIF1P55008 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AIF1P55008 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AIF1P55008 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AIF1P55008 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AIF1P55008 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AIF1P55008 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AIF1P55008 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AIF1P55008 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AIF1P55008 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AIF1P55008 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AIF1P55008 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AIF1P55008 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AIF1P55008 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AIF1P55008 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AIF1P55008 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AIF1P55008 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AIF1P55008 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AIF1P55008 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AIF1P55008 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AIF1P55008 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AIF1P55008 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AIF1P55008 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AIF1P55008 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AIF1P55008 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AIF1P55008 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AIF1P55008 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AIF1P55008 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AIF1P55008 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AIF1P55008 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AIF1P55008 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AIF1P55008 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AIF1P55008 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AIF1P55008 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AIF1P55008 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AIF1P55008 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AIF1P55008 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AIF1P55008 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AIF1P55008 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AIF1P55008 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AIF1P55008 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AIF1P55008 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AIF1P55008 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AIF1P55008 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AIF1P55008 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AIF1P55008 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AIF1P55008 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AIF1P55008 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AIF1P55008 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AIF1P55008 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AIF1P55008 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AIF1P55008 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AIF1P55008 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AIF1P55008 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AIF1P55008 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AIF1P55008 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AIF1P55008 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AIF1P55008 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AIF1P55008 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AIF1P55008 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AIF1P55008 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AIF1P55008 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AIF1P55008 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AIF1P55008 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AIF1P55008 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AIF1P55008 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms