Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB1P54762 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms