Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF143P52747 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms