Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF135P52742 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms