Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTAP49354 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTAP49354 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTAP49354 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTAP49354 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTAP49354 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTAP49354 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTAP49354 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTAP49354 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTAP49354 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTAP49354 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTAP49354 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTAP49354 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTAP49354 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTAP49354 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTAP49354 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTAP49354 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTAP49354 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTAP49354 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTAP49354 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTAP49354 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTAP49354 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTAP49354 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTAP49354 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTAP49354 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTAP49354 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTAP49354 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTAP49354 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTAP49354 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTAP49354 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTAP49354 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTAP49354 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTAP49354 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTAP49354 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTAP49354 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTAP49354 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTAP49354 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTAP49354 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTAP49354 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTAP49354 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTAP49354 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTAP49354 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTAP49354 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTAP49354 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTAP49354 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTAP49354 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTAP49354 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTAP49354 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTAP49354 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTAP49354 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTAP49354 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTAP49354 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTAP49354 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTAP49354 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTAP49354 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTAP49354 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTAP49354 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTAP49354 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTAP49354 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTAP49354 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTAP49354 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTAP49354 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTAP49354 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTAP49354 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTAP49354 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTAP49354 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTAP49354 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTAP49354 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTAP49354 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTAP49354 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTAP49354 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTAP49354 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTAP49354 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTAP49354 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTAP49354 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTAP49354 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms