Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ME1P48163 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ME1P48163 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ME1P48163 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ME1P48163 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ME1P48163 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ME1P48163 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ME1P48163 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ME1P48163 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ME1P48163 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ME1P48163 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ME1P48163 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ME1P48163 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ME1P48163 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ME1P48163 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ME1P48163 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ME1P48163 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ME1P48163 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ME1P48163 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ME1P48163 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ME1P48163 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ME1P48163 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ME1P48163 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ME1P48163 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ME1P48163 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ME1P48163 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ME1P48163 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ME1P48163 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ME1P48163 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ME1P48163 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ME1P48163 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ME1P48163 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ME1P48163 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ME1P48163 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ME1P48163 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ME1P48163 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ME1P48163 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ME1P48163 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ME1P48163 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ME1P48163 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ME1P48163 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ME1P48163 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ME1P48163 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms