Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB2P47870 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.4 ms