Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms