Protein–RNA interactions for Protein: P29350

PTPN6, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN6P29350 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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PTPN6P29350 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PTPN6P29350 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PTPN6P29350 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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