Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GCAP28676 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCAP28676 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCAP28676 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCAP28676 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCAP28676 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCAP28676 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCAP28676 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCAP28676 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCAP28676 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms