Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms