Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 243.5 ms