Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO1P25800 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO1P25800 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO1P25800 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO1P25800 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO1P25800 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO1P25800 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO1P25800 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO1P25800 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO1P25800 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO1P25800 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO1P25800 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO1P25800 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO1P25800 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO1P25800 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO1P25800 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO1P25800 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO1P25800 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO1P25800 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO1P25800 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO1P25800 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO1P25800 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO1P25800 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO1P25800 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO1P25800 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO1P25800 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO1P25800 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO1P25800 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO1P25800 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO1P25800 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO1P25800 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO1P25800 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO1P25800 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO1P25800 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO1P25800 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO1P25800 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO1P25800 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO1P25800 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO1P25800 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO1P25800 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO1P25800 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO1P25800 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO1P25800 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO1P25800 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO1P25800 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO1P25800 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO1P25800 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO1P25800 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO1P25800 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO1P25800 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO1P25800 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO1P25800 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO1P25800 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO1P25800 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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