Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCM3P25205 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCM3P25205 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCM3P25205 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCM3P25205 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCM3P25205 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCM3P25205 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCM3P25205 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCM3P25205 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MCM3P25205 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCM3P25205 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCM3P25205 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCM3P25205 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCM3P25205 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCM3P25205 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCM3P25205 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCM3P25205 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCM3P25205 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCM3P25205 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCM3P25205 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCM3P25205 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCM3P25205 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MCM3P25205 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCM3P25205 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCM3P25205 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCM3P25205 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCM3P25205 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCM3P25205 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCM3P25205 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCM3P25205 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCM3P25205 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCM3P25205 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCM3P25205 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCM3P25205 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCM3P25205 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCM3P25205 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCM3P25205 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCM3P25205 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCM3P25205 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCM3P25205 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCM3P25205 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCM3P25205 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCM3P25205 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCM3P25205 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCM3P25205 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MCM3P25205 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCM3P25205 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MCM3P25205 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MCM3P25205 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCM3P25205 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCM3P25205 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCM3P25205 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms