Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
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