Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms