Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CXCL2P19875 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL2P19875 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL2P19875 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL2P19875 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL2P19875 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL2P19875 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL2P19875 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL2P19875 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL2P19875 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL2P19875 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL2P19875 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL2P19875 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL2P19875 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL2P19875 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL2P19875 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL2P19875 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL2P19875 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL2P19875 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL2P19875 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL2P19875 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL2P19875 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL2P19875 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL2P19875 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL2P19875 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL2P19875 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL2P19875 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL2P19875 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL2P19875 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL2P19875 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL2P19875 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL2P19875 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL2P19875 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL2P19875 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL2P19875 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL2P19875 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL2P19875 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL2P19875 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL2P19875 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL2P19875 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 228.8 ms