Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA1P17302 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA1P17302 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA1P17302 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA1P17302 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA1P17302 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA1P17302 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA1P17302 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA1P17302 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA1P17302 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA1P17302 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA1P17302 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA1P17302 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA1P17302 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA1P17302 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA1P17302 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA1P17302 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA1P17302 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA1P17302 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA1P17302 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA1P17302 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA1P17302 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA1P17302 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA1P17302 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA1P17302 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA1P17302 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA1P17302 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA1P17302 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA1P17302 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA1P17302 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA1P17302 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA1P17302 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GJA1P17302 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GJA1P17302 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GJA1P17302 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GJA1P17302 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms