Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 AL445218.1-202ENST00000427695 845 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 PLSCR2-205ENST00000497985 1441 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 AC246787.1-201ENST00000392301 627 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 LINC02207-201ENST00000554530 1256 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB3P14651 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms