Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC130P13994 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms