Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMC1P11047 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms