Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB1P08034 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB1P08034 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB1P08034 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB1P08034 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB1P08034 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB1P08034 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB1P08034 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB1P08034 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB1P08034 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJB1P08034 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB1P08034 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB1P08034 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB1P08034 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB1P08034 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB1P08034 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB1P08034 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB1P08034 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB1P08034 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB1P08034 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB1P08034 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB1P08034 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB1P08034 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB1P08034 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB1P08034 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB1P08034 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB1P08034 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB1P08034 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB1P08034 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB1P08034 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB1P08034 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB1P08034 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB1P08034 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB1P08034 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB1P08034 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB1P08034 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB1P08034 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB1P08034 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB1P08034 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB1P08034 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB1P08034 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB1P08034 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB1P08034 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB1P08034 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB1P08034 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB1P08034 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB1P08034 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB1P08034 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB1P08034 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB1P08034 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB1P08034 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJB1P08034 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB1P08034 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB1P08034 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB1P08034 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB1P08034 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB1P08034 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB1P08034 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB1P08034 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB1P08034 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB1P08034 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB1P08034 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB1P08034 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB1P08034 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB1P08034 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB1P08034 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB1P08034 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB1P08034 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB1P08034 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB1P08034 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB1P08034 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB1P08034 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB1P08034 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB1P08034 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB1P08034 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB1P08034 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB1P08034 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB1P08034 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB1P08034 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB1P08034 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB1P08034 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB1P08034 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB1P08034 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB1P08034 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB1P08034 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB1P08034 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB1P08034 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB1P08034 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB1P08034 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB1P08034 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB1P08034 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJB1P08034 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms