Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RBBP9O75884 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms